любой сложный софт продукт постоянно обновяется - патчится. Всю его жизнь.
Поэтому - предоставление исходников - это только начало. Вопрос - кто делает патчи и новые "билды" - и кто это проверяет? Не говоря уже о том что каждая установка винды норовит авторизоваться - "доложить" о себе в Микрософт.
НИ для каких РТ приложний нет никакой нужды использовать винду - для того не предназначенную - и если она для этого используется в промышленности- то для того есть коммерческие и экономические резоны - но совершенно никаких технических.
В "светочи" - до сих пор используют АДА - речь идет о надежности генерируемого кода - хотя тенденция - переход на коммерческие продукты. Ну и что - это их тенденция - необязательно наилучий вариант для нас?